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  • 我实验室硕士生在《Physiologia Plantarum》发挥论文

    来源: 林木育种国家工程办公室        笔者:fym       浏览次数:    发挥时间(2014-05-30)

    林木育种国家工程办公室硕士生王厚领之学术论文“Identication and validation of reference genes for Populuseuphratica gene expression analysis during abiotic stresses by quantitative real-time PCR”发挥于SCI期刊《PhysiologiaPlantarum(DOI: 10.1111/ppl.12206),提醒团队为夏新莉讲课课题组,该工作由江山高技能研究提高准备(863精算,No.2013AA102701)、江山自然科学基金(31270656)”等项目资助。

    实时荧光定量PCR(qRT-PCR)是当前最常用的研讨基因表达模式的年代学技术手段之一,但人家有一点不足是实验结果高度依赖于内参基因,背景基因好比是参照物,参照物的不安和不安宁发挥,会立竿见影需要研究之目的基因的表述模式有错误、离开真实值、甚至完全错误的结果,评议和评价合适的背景基因是拥有可信qRT-PCR结果的首要前提条件。胡杨里这一研究尚属空白。胡杨生长并建队于流沙面积世界主要之塔克拉玛干沙漠,是该荒漠地区唯一的林木树种,漫长适应干旱、高盐碱、强烈昼夜温差的荒漠环境,有效胡杨具有丰富的抗逆基因资源,具有关键的研讨和采取价值。

    资产研究对包括Actin,18S,UBQ,EF1α,TUB,GAPDH在内的16个候选内参基因,在外源脱落酸、寒冷、脱水、干旱、短期盐、漫长盐等六种非生物胁迫下的长治久安, geNorm等四种分析方法进行排序,合同R硬件程序包RankAggreg开展加权平均聚合,得到最终的长治久安排序。接下来用排名靠前的和排名靠后的背景基因, 分手对三个胡杨基因进行表达模式分析(其中一个已知),结果发现,租用不同之背景基因将会对实验结果有很大影响,行靠前的背景基因得到的尝试结果更贴近于预期值。同时该研究还详细介绍了利用多内参基因组合替代传统单一内参基因进行qRT-PCR的主意。研讨结果对于胡杨内参基因的挑选具有关键的提示意义,同时也为另外杨树逆境胁迫下内参基因的挑选提供了参考,具有关键的论战和采取价值。

    PhysiologiaPlantarum》是Wiley online旗下植物学期刊之一,创业于1948年,2012年影响因子3.656,五年影响因子3.473